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All Coding Repeats of Dinoroseobacter shibae DFL 12 plasmid pDSHI03

Total Repeats: 2318

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009957	CG	3	6	24	29	0 %	0 %	50 %	50 %	159046470
2	NC_009957	ATC	3	9	55	63	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159046470
3	NC_009957	CCG	2	6	109	114	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046470
4	NC_009957	CT	4	8	132	139	0 %	50 %	0 %	50 %	159046470
5	NC_009957	CAG	2	6	216	221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046470
6	NC_009957	TCA	2	6	233	238	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159046470
7	NC_009957	GC	3	6	294	299	0 %	0 %	50 %	50 %	159046470
8	NC_009957	CAG	2	6	300	305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046470
9	NC_009957	TCG	2	6	323	328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046470
10	NC_009957	GACC	2	8	414	421	25 %	0 %	25 %	50 %	159046470
11	NC_009957	GGGT	2	8	516	523	0 %	25 %	75 %	0 %	159046470
12	NC_009957	ATC	2	6	546	551	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159046470
13	NC_009957	CCG	2	6	556	561	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046470
14	NC_009957	GCG	2	6	587	592	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046470
15	NC_009957	CAG	2	6	681	686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046470
16	NC_009957	CTGT	2	8	757	764	0 %	50 %	25 %	25 %	159046470
17	NC_009957	GGTCA	2	10	858	867	20 %	20 %	40 %	20 %	159046471
18	NC_009957	GCG	2	6	964	969	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046471
19	NC_009957	TTCGC	2	10	1155	1164	0 %	40 %	20 %	40 %	159046471
20	NC_009957	GTC	2	6	1248	1253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046471
21	NC_009957	CG	3	6	1268	1273	0 %	0 %	50 %	50 %	159046471
22	NC_009957	ATG	2	6	1303	1308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159046471
23	NC_009957	GTG	2	6	1317	1322	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159046471
24	NC_009957	GC	3	6	1333	1338	0 %	0 %	50 %	50 %	159046471
25	NC_009957	CCAG	2	8	1376	1383	25 %	0 %	25 %	50 %	159046471
26	NC_009957	CGC	2	6	1389	1394	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046471
27	NC_009957	ACA	2	6	1454	1459	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	159046471
28	NC_009957	AGA	2	6	1529	1534	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	159046471
29	NC_009957	GAAC	2	8	1568	1575	50 %	0 %	25 %	25 %	159046471
30	NC_009957	ATC	2	6	1597	1602	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159046471
31	NC_009957	AGT	2	6	1616	1621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159046471
32	NC_009957	ACGAG	2	10	1817	1826	40 %	0 %	40 %	20 %	159046472
33	NC_009957	CGT	2	6	1928	1933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046472
34	NC_009957	CGT	2	6	1960	1965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046472
35	NC_009957	CGA	2	6	1969	1974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046472
36	NC_009957	T	6	6	1975	1980	0 %	100 %	0 %	0 %	159046472
37	NC_009957	CGGGGT	2	12	2020	2031	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	159046472
38	NC_009957	GC	3	6	2072	2077	0 %	0 %	50 %	50 %	159046472
39	NC_009957	TGG	2	6	2093	2098	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159046472
40	NC_009957	AACG	2	8	2104	2111	50 %	0 %	25 %	25 %	159046472
41	NC_009957	AAC	2	6	2174	2179	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	159046472
42	NC_009957	CG	3	6	2192	2197	0 %	0 %	50 %	50 %	159046472
43	NC_009957	GAAC	2	8	2247	2254	50 %	0 %	25 %	25 %	159046472
44	NC_009957	GC	3	6	2292	2297	0 %	0 %	50 %	50 %	159046472
45	NC_009957	GAG	2	6	2385	2390	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	159046472
46	NC_009957	GCTG	2	8	2523	2530	0 %	25 %	50 %	25 %	159046473
47	NC_009957	CAG	2	6	2543	2548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046473
48	NC_009957	AC	3	6	2551	2556	50 %	0 %	0 %	50 %	159046473
49	NC_009957	ACG	2	6	2603	2608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046473
50	NC_009957	GGT	2	6	2629	2634	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159046473
51	NC_009957	CCGC	2	8	2672	2679	0 %	0 %	25 %	75 %	159046473
52	NC_009957	GGA	2	6	2700	2705	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	159046473
53	NC_009957	GGAT	2	8	2747	2754	25 %	25 %	50 %	0 %	159046473
54	NC_009957	CTCA	2	8	2767	2774	25 %	25 %	0 %	50 %	159046473
55	NC_009957	TCG	2	6	2900	2905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046473
56	NC_009957	GTT	2	6	2941	2946	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	159046473
57	NC_009957	TTC	2	6	2950	2955	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159046473
58	NC_009957	ACG	2	6	2984	2989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046473
59	NC_009957	CGA	2	6	3279	3284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046473
60	NC_009957	GCCC	2	8	3384	3391	0 %	0 %	25 %	75 %	159046473
61	NC_009957	GCCT	2	8	3491	3498	0 %	25 %	25 %	50 %	159046473
62	NC_009957	CCG	2	6	3515	3520	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046473
63	NC_009957	GAC	2	6	3528	3533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046473
64	NC_009957	CG	3	6	3534	3539	0 %	0 %	50 %	50 %	159046473
65	NC_009957	CCA	2	6	3591	3596	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159046473
66	NC_009957	GCG	2	6	3613	3618	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046473
67	NC_009957	TCG	2	6	3680	3685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046473
68	NC_009957	TGC	2	6	3710	3715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046473
69	NC_009957	CCA	2	6	3732	3737	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159046473
70	NC_009957	TC	3	6	3906	3911	0 %	50 %	0 %	50 %	159046474
71	NC_009957	GCG	2	6	3921	3926	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046474
72	NC_009957	GCC	2	6	3936	3941	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046474
73	NC_009957	TGG	2	6	4149	4154	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159046474
74	NC_009957	CTT	2	6	4165	4170	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159046474
75	NC_009957	TGC	2	6	4216	4221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046474
76	NC_009957	CTTG	2	8	4326	4333	0 %	50 %	25 %	25 %	159046474
77	NC_009957	TGGT	2	8	4338	4345	0 %	50 %	50 %	0 %	159046474
78	NC_009957	GAC	2	6	4453	4458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046475
79	NC_009957	AGC	2	6	4544	4549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046475
80	NC_009957	CGCC	2	8	4567	4574	0 %	0 %	25 %	75 %	159046475
81	NC_009957	CAA	2	6	4588	4593	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	159046475
82	NC_009957	GCT	2	6	4619	4624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046475
83	NC_009957	CG	3	6	4685	4690	0 %	0 %	50 %	50 %	159046475
84	NC_009957	CCG	2	6	4784	4789	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046475
85	NC_009957	CAA	2	6	4886	4891	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	159046475
86	NC_009957	GCA	2	6	4900	4905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046475
87	NC_009957	TCG	2	6	4921	4926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046475
88	NC_009957	GCA	2	6	4972	4977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046475
89	NC_009957	GGC	2	6	4980	4985	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046475
90	NC_009957	TGCG	2	8	5001	5008	0 %	25 %	50 %	25 %	159046475
91	NC_009957	GTC	2	6	5236	5241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046476
92	NC_009957	A	6	6	5314	5319	100 %	0 %	0 %	0 %	159046476
93	NC_009957	GAC	2	6	5467	5472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046476
94	NC_009957	GCT	2	6	5623	5628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046476
95	NC_009957	TGT	2	6	5649	5654	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	159046476
96	NC_009957	TGA	2	6	5712	5717	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159046476
97	NC_009957	ATG	2	6	6260	6265	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159046477
98	NC_009957	GGT	2	6	6272	6277	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159046477
99	NC_009957	ATG	2	6	6284	6289	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159046477
100	NC_009957	ATG	2	6	6305	6310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159046477
101	NC_009957	ATG	2	6	6314	6319	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159046477
102	NC_009957	ATG	2	6	6338	6343	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159046477
103	NC_009957	ATG	2	6	6353	6358	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159046477
104	NC_009957	ATG	2	6	6380	6385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159046477
105	NC_009957	TGGC	2	8	6396	6403	0 %	25 %	50 %	25 %	159046477
106	NC_009957	ATG	2	6	6407	6412	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159046477
107	NC_009957	ACG	2	6	6443	6448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046477
108	NC_009957	GAA	2	6	6452	6457	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	159046477
109	NC_009957	GAT	2	6	6550	6555	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159046477
110	NC_009957	ATG	2	6	6563	6568	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159046477
111	NC_009957	GAT	2	6	6661	6666	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159046477
112	NC_009957	ATG	2	6	6731	6736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159046477
113	NC_009957	CTGA	2	8	6985	6992	25 %	25 %	25 %	25 %	159046478
114	NC_009957	CGA	2	6	7007	7012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046478
115	NC_009957	GCC	2	6	7038	7043	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046478
116	NC_009957	ATCGAG	2	12	7090	7101	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	159046478
117	NC_009957	TGC	2	6	7382	7387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046479
118	NC_009957	G	7	7	7441	7447	0 %	0 %	100 %	0 %	159046479
119	NC_009957	TGGC	2	8	7500	7507	0 %	25 %	50 %	25 %	159046479
120	NC_009957	CCG	2	6	7558	7563	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046479
121	NC_009957	TCT	2	6	7587	7592	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159046479
122	NC_009957	ATC	3	9	7600	7608	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159046479
123	NC_009957	TGG	2	6	7620	7625	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159046479
124	NC_009957	GGC	2	6	7702	7707	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046479
125	NC_009957	G	6	6	7720	7725	0 %	0 %	100 %	0 %	159046479
126	NC_009957	ACC	2	6	7815	7820	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159046479
127	NC_009957	CAA	2	6	7854	7859	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	159046479
128	NC_009957	GCTG	2	8	8036	8043	0 %	25 %	50 %	25 %	159046479
129	NC_009957	TGGC	2	8	8060	8067	0 %	25 %	50 %	25 %	159046479
130	NC_009957	TCG	2	6	8102	8107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046479
131	NC_009957	CAA	2	6	8128	8133	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	159046479
132	NC_009957	CGG	2	6	8141	8146	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046479
133	NC_009957	CGG	2	6	8254	8259	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046479
134	NC_009957	CAG	2	6	8408	8413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046480
135	NC_009957	CTT	2	6	8414	8419	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159046480
136	NC_009957	ATC	2	6	8534	8539	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159046480
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155	NC_009957	CGA	2	6	9324	9329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046480
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247	NC_009957	CGG	2	6	14530	14535	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046484
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252	NC_009957	CAGC	2	8	14829	14836	25 %	0 %	25 %	50 %	159046485
253	NC_009957	CGTTT	2	10	14866	14875	0 %	60 %	20 %	20 %	159046485
254	NC_009957	GAC	2	6	15353	15358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046486
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257	NC_009957	GCG	2	6	15474	15479	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046486
258	NC_009957	GCG	2	6	15488	15493	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046486
259	NC_009957	GCG	2	6	15528	15533	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046486
260	NC_009957	TGCCTA	2	12	15564	15575	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	159046486
261	NC_009957	TGG	2	6	15576	15581	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159046486
262	NC_009957	TGG	3	9	15684	15692	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159046486
263	NC_009957	T	6	6	15722	15727	0 %	100 %	0 %	0 %	159046486
264	NC_009957	CTT	3	9	15745	15753	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159046486
265	NC_009957	TCGCTT	2	12	15755	15766	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	159046486
266	NC_009957	GGGC	2	8	15788	15795	0 %	0 %	75 %	25 %	159046486
267	NC_009957	CTC	2	6	15815	15820	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	159046486
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270	NC_009957	CGGCCG	2	12	15879	15890	0 %	0 %	50 %	50 %	159046486
271	NC_009957	GCG	3	9	15918	15926	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046486
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273	NC_009957	CGA	2	6	16024	16029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046486
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277	NC_009957	ATGCCC	2	12	16131	16142	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	159046486
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279	NC_009957	GTGG	2	8	16162	16169	0 %	25 %	75 %	0 %	159046486
280	NC_009957	CG	3	6	16177	16182	0 %	0 %	50 %	50 %	159046486
281	NC_009957	AC	3	6	16188	16193	50 %	0 %	0 %	50 %	159046486
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287	NC_009957	CGGG	2	8	16364	16371	0 %	0 %	75 %	25 %	159046486
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293	NC_009957	GC	3	6	16663	16668	0 %	0 %	50 %	50 %	159046486
294	NC_009957	GGCTC	2	10	16674	16683	0 %	20 %	40 %	40 %	159046486
295	NC_009957	CGG	2	6	16725	16730	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046486
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298	NC_009957	CG	5	10	16912	16921	0 %	0 %	50 %	50 %	159046486
299	NC_009957	CGA	2	6	16942	16947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046486
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377	NC_009957	CCA	2	6	20365	20370	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159046491
378	NC_009957	GC	3	6	20373	20378	0 %	0 %	50 %	50 %	159046491
379	NC_009957	GCA	2	6	20522	20527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046491
380	NC_009957	CGA	2	6	20535	20540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046491
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382	NC_009957	CCAG	2	8	20566	20573	25 %	0 %	25 %	50 %	159046492
383	NC_009957	AAC	2	6	20583	20588	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	159046492
384	NC_009957	TGA	2	6	20671	20676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159046492
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387	NC_009957	CGA	2	6	20773	20778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046492
388	NC_009957	GCG	2	6	20790	20795	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046492
389	NC_009957	ACCGCC	2	12	20841	20852	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	159046492
390	NC_009957	CCCG	2	8	20900	20907	0 %	0 %	25 %	75 %	159046492
391	NC_009957	CCGACG	2	12	20928	20939	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	159046492
392	NC_009957	GAT	2	6	20975	20980	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159046492
393	NC_009957	CGC	2	6	20994	20999	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046492
394	NC_009957	GCG	2	6	21006	21011	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046492
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396	NC_009957	GCC	2	6	21111	21116	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046492
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499	NC_009957	GACC	2	8	26582	26589	25 %	0 %	25 %	50 %	159046500
500	NC_009957	TTC	2	6	26770	26775	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159046501

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